為提高畜禽養殖廢棄物的利用價值，減少傳統處理手段帶來的環境污染問題，我們應該加大對有機肥工藝的應用力度。目前，畜禽養殖廢棄物生產有機肥的工藝流程主要有發酵后造粒做粒狀產品、發酵后做粉狀產品，以及添加微生物菌劑做生物有機肥等。其中，比較主流的工藝為發酵后造粒。
1、發酵
有機肥生產的發酵環節主要是提供有利于廢棄物發酵的菌種、輔料及溫濕度環境等，促使畜禽廢棄物快速發酵，然后再通過一定的造粒手段進行處理，最終得到植物營養元素的有機成品。目前比較常用的有機肥發酵技術包括反應器發酵和堆式發酵兩大類,其處理過程如下：首先對畜禽糞便進行預處理，然后加入菌種、輔料，于攪拌機內攪勻，再用皮帶運輸機運至發酵塔頂層，之后每天翻塔一次，即可發酵完成。與傳統的堆式發酵工藝相比，塔式發酵的占地面積小、發酵速度快、處理能力強，可以更好地滿足畜禽養殖廢棄物處理的需要。
2、造粒
有機肥發酵完成后，還需要進行造粒處理。常用的造粒技術包括團粒法和擠壓法，前者在造粒機內進行，需要將原料按一定配方在攪拌機內攪勻，然后運至造粒機內進行制粒，之后進行干燥、篩分、冷卻、返料、包裹、尾氣凈化等一系列處理，最終得到有機肥成品。擠壓法是一種直接擠壓的造粒方法，產能較低，所得顆粒的外觀粗糙、含水量高，且容易發生粉化現象，在實際生產中團粒法更受歡迎。團粒法的產能較高，所生產出來的肥料顆粒具有外表光滑、粒度均勻等特點。物料經造粒機加工成顆粒后，由陳化皮送至干燥機內，利用熱空氣進行順流干燥，待徹底干燥后再經出口提升機送入滾篩內進行篩分處理。在篩分過程中，細粉被直接篩除，經返料皮帶送回重新造粒；較大的顆粒在自流作用下進入破碎機中進行破碎處理，然后經返料皮帶送回重新造粒；粒徑達標得顆粒輸送至冷卻機中，利用空氣逆流散熱，待冷卻至合適溫度后再送入包裹筒內與其它輔料混合，最后送到成品貯斗中等待包裝處理。
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